Die Dünen von Khongor, "Khongoriin Els", bilden die größte Sandansammlung im Nationalpark Gobi Gurvan Saïkhan. Mit einer Fläche von über 900 km² gehören sie zu den größten Sandzonen der Mongolei. Sie erheben sich abrupt aus der Ebene und zählen zweifellos zu den spektakulärsten des Landes. Der Wind weht ständig von Norden nach Westen über die Dünen, die dabei schwindelerregende Höhen erreichen können – zwischen 100 und 300 Metern an ihren höchsten Gipfeln. Sie erstrecken sich über mehr als 180 km Länge und erreichen stellenweise eine Breite von 27 km. Die Einheimischen nennen ihre imposanten Dünen "Singende Dünen", wegen des Geräusches, das der Wind macht, wenn er den Sand bewegt. Jenseits der Dünen erstreckt sich die Steppe endlos.

Die Dünen von Khongor haben einen besonderen Reiz durch ihre beeindruckende Farbkombination – die Sanddünen schimmern in zartem Gelb. Sie werden im Norden von einem Streifen grüner und üppiger Vegetation begrenzt, die durch einen kleinen Fluss abgegrenzt wird: Khongoriin Gol. Dieser kleine Fluss, gespeist von unterirdischen Quellen, fließt einige Kilometer lang entlang der Dünen und bildet so eine Oase inmitten der ausgetrockneten Landschaft. Diese Region ist auch besonders reich an Fossilien und Überresten von Dinosauriern sowie an Mineralvorkommen.